CRISPR 유전자 편집 후 발생하는 Off-target 효과 최소화를 위한 염기쌍 밀도 기반 가이드 RNA 설계 전략

Off-target 효과는 원하는 표적 외의 부위를 편집하여 예상치 못한 유전체 변이를 일으키는 현상으로, 안전한 유전자 치료 적용의 주요 난제로 남아 있습니다.

최신 설계 패러다임

• 기존의 단순 염기서열 유사성 매칭 방식에서 벗어나, 타겟 부위의 염기쌍 밀도 및 주변 구조적 특성을 고려한 gRNA 설계가 중요해지고 있습니다.
• 높은 Cas9 활성 부위 근처의 염기쌍 밀도가 낮을 경우, 비표적 결합 확률이 증가한다는 연구 결과들이 제시되고 있으며, 이를 반영한 알고리즘 개발이 진행 중입니다.

현재 학계에서는 이러한 구조적 정보를 통합하여 편집 정확도를 높이는 AI 기반 예측 모델 구축에 집중하고 있으나, 실제 생체 내 다양한 환경 요인이 미치는 영향에 대한 완벽한 이해는 여전히 부족합니다.